System komputerowej analizy NIS Elements (Nikon Imaging Software) wykorzystywany jest we wszelkiego rodzaju badaniach mikroskopowych.

Oprogramowanie NIS pozwala na dokonywanie oceny ilościowej i jakościowej badanych próbek poprzez automatyczne zliczanie obiektów, pomiary planimetryczne (długość, pole powierzchni, średnica, obwód, współczynniki kształtu i inne) i densytometryczne (jasność, gęstość optyczna, odcień, nasycenie, poziomy składowych RGB).

NIS umożliwia również edycję i zaawansowaną obróbkę obrazu oraz posiada rozbudowane narzędzia do jego archiwizacji.

System NIS znalazł zastosowanie w takich dziedzinach nauki i techniki jak: biologia, medycyna, botanika, geologia, zabytkoznawstwo, kryminalistyka, włókiennictwo, materiałoznawstwo, metalografia i inne.

Oprogramowanie serii NIS dostępne jest w kilku wersjach: od wariantu F, oferowanego bezpłatnie z kamerami Nikona poprzez warianty D i BR, które mogą być rozbudowywane, aż do najbardziej rozwiniętej wersji NIS-Elements AR.